Как сделать из ПК суперкомпьютер

Научные исследования в области поиска новых форм лекарств, традиционно долговременные, смогут существенно ускориться благодаря программе AMBER 11

Новая версия популярного приложения для биохимиков и других ученых, занимающихся молекулярной динамикой, была оптимизирована для работы с графическими процессорами NVIDIA, что обеспечило прирост скорости вычислений до 100 раз по сравнению с сервером на базе CPU. Для этого AMBER 11 использует возможности графических процессоров серии NVIDIA Tesla 20, включая архитектуру параллельных вычислений CUDA, специально созданную для ресурсоемких вычислительных приложений.

Благодаря GPU большую часть работы можно делать на настольном ПК с соответствующей графической картой, и ученым не придется несколько дней ждать очереди на суперкомпьютер или кластер серверов факультета для проведения вычислительного эксперимента. Один GPU Tesla обеспечивает такую же мощь, как и кластер из 512 CPU при моделировании одной наносекунды в жизненном цикле 25000-атомной нуклеосомы.